Cinco pokemon Genesect han invadido la ciudad por causas que se desconocen. Estos pokemon no resultan peligrosos para las personas al menos en un principio pero si para la electricidad lo que puede causar muchos problemas a los habitantes que dependen de esta energia para sus tareas cotidianas. Esta invasion atrae a Mewtwo que es uno de los pokemon legendarios. No se saben las intenciones de este pokemon lo que hace que todo el mundo se ponga nervioso puesto que nadie sabe lo que pasa. Ash Pikachu y todos sus amigos deciden ir al rescate de la ciudad enfrentando a sus pokemon con los que han invadido la ciudad para que dejen a los habitantes tranquilos y puedan seguir su vida normal. De repente sucede algo inesperado cuando un enorme Genesect de color rojo ataca a Mewtwo algo de los que Ash Pikachu y todos los que los acompañan seran testigos.