Alex el leon es el rey de la selva urbana es la atraccion estelar del zoo neoyorquino de Central Park. Como sus mejores amigos Marty la cebra Melman la jirafa y Gloria la hipopotamo Alex ha pasado toda su vida en feliz e ignorante captividad bien alimentado y en una jaula con excelentes vistas al parque. No contento con su vida Marty se deja llevar por la curiosidad y con ayuda de unos prodigiosos pingüinos escapa del zoo para conocer mundo con la intencion de volver antes de que se haga de dia. Alex Melman y Gloria descubren su fuga y deciden salir en su busca antes de que alguien se de cuenta de su desaparicion. Incluso en una ciudad como Nueva York no deja de llamar la atencion ver a un leon una jirafa y un hipopotamo andando por la calle y montando en metro. Los tres amigos consiguen encontrar a Marty en la estacion Central pero antes de que puedan volver al zoo loscapturan y los embarcan con rumbo a Africa. Los pingüinos sabotean el crucero y los cuatro amigos aparecen en una playa de la exotica isla de Madagascar. Estos nativos de Nueva York deben aprender a sobrevivir en estado silvestre es entonces cuando comprenden el sentido de la expresion “el mundo de ahi fuera es una jungla”.