El ascenso al poder del joven y sanguinario Lord Naritsugu supone una seria amenaza para la paz en el Japon feudal. Simplemente por ser el hermano del shogun Lord Naritsugu esta por encima de la ley y asesina y viola a su antojo. Afligido por las masacres perpetradas por el sadico Naritsugu el oficial Sir Doi se pone en contacto con el samurai Shinzaemon Shimada para que le ayude a acabar con Naritsugu. El noble samurai indignado por la crueldad de Naritsugu acepta de buen grado la peligrosa mision. Para ello reune a un selecto grupo de samurais entre los que se encuentra su sobrino Shinrokuro y el devoto aprendiz Hirayama y juntos traman una emboscada para atrapar a Lord Naritsugu no exenta de peligro. Naritsugu va escoltado por una comitiva encabezada por el letal e implacable Hanbei uno de sus antiguos rivales. Los 13 asesino de Takashi Miike es un remake del film homonimo dirigido por Eichi Kudo en 1963.