Mientras trabajan en una averia subterranea los fontaneros de Brooklyn Mario y su hermano Luigi viajan por una misteriosa tuberia hasta un nuevo mundo magico. Pero cuando los hermanos se separan Mario debera emprender una epica mision para encontrar a Luigi. Con la ayuda del champiñon local Toad y unas cuantas nociones de combate de la guerrera lider del Reino Champiñon la princesa Peach Mario descubre todo el poder que alberga en su interior.