En un futuro los Kaijus lograran conquistar la Tierra. La humanidad debera dejar el que fuera su hogar durante mucho tiempo para mudarse a otro planeta que por desgracia no podra albergarlos. Su unica esperanza de sobrevivir es volver a la Tierra y vencer a Godzilla. Sin embargo tras su regreso habran pasado 20.000s de dominio Kaiju por lo que la humanidad debera enfrentarse a lo peor.